該部的主要職責(zé)是管理和實施原子能機構(gòu)保障。該司還通過對與相關(guān)協(xié)定和安排有關(guān)的核查和其他技術(shù)援助請求作出回應(yīng)，促進核軍控和裁軍。

業(yè)務(wù)處

該部設(shè)有三個業(yè)務(wù)處和伊朗核查辦公室，在對有生效的保障協(xié)定國家進行以下核查中發(fā)揮著關(guān)鍵作用：不存在已申報核材料從和平核活動中轉(zhuǎn)用的情況，且在整個國家中不存在未申報的核材料或核活動的跡象。各處負責(zé)在不同的地理區(qū)域?qū)嵤┍Ｕ希?/p>

• 業(yè)務(wù)一處——澳大拉西亞和東亞
• 業(yè)務(wù)二處——中東、南亞、非洲、一些非歐盟的歐洲國家和美洲
• 業(yè)務(wù)三處——歐洲、俄羅斯聯(lián)邦和中亞
• 伊朗核查辦公室

各處對照根據(jù)相關(guān)的“保障協(xié)定”和“附加議定書”（酌情）開展的原子能機構(gòu)核查活動的結(jié)果以及原子能機構(gòu)獲得的所有其他保障相關(guān)資料，對各國已申報核計劃的一致性進行評價。特別是，各處根據(jù)原子能機構(gòu)獲得的有關(guān)一國核活動和核相關(guān)活動的所有資料，進行全面國家評價。

概念和規(guī)劃處

該處制定對核材料、核設(shè)施和核活動實施保障的概念、方案和方法；擬訂保障政策和導(dǎo)則文件；協(xié)助業(yè)務(wù)處處理保障執(zhí)行問題；為咨詢和決策機構(gòu)提供支持。該處還為保障司進行戰(zhàn)略規(guī)劃，協(xié)調(diào)研究和發(fā)展活動，包括管理成員國支助計劃。該處還通過培訓(xùn)、咨詢工作組訪問和導(dǎo)則文件向成員國的人員提供援助。

信息管理處

該處的核心任務(wù)是運作和開發(fā)一個專業(yè)信息分析員和數(shù)據(jù)處理專家?guī)欤⒔邮?、處理和分析衡算?shù)據(jù)和附加議定書聲明。該處評價物料平衡以及核材料、非核材料和環(huán)境樣品的分析結(jié)果，并提供其他統(tǒng)計支持。該處還收集、處理和分析科學(xué)、技術(shù)和政治文獻以及地理空間信息，開發(fā)和實施新的信息收集、處理和分析的技術(shù)和方法。

技術(shù)和科學(xué)服務(wù)處

該處向各業(yè)務(wù)處提供科學(xué)和技術(shù)支持。這包括保障設(shè)備的設(shè)計、開發(fā)、測試、校準(zhǔn)、安裝和維護；設(shè)備的性能和污染監(jiān)測；視察的后勤工作。

保障分析服務(wù)辦公室

該辦公室負責(zé)分析核材料和環(huán)境擦拭樣品，提供相關(guān)的取樣和質(zhì)量控制材料，協(xié)調(diào)樣品運輸物流以及與分析實驗室網(wǎng)絡(luò)中成員國機構(gòu)的合作。該辦公室由各保障分析實驗室組成，其中包括環(huán)境樣品實驗室和核材料實驗室，還有一個位于日本六所村的現(xiàn)場實驗室。該辦公室還包括一個協(xié)調(diào)和支助科，負責(zé)規(guī)劃、協(xié)調(diào)和報告分析實驗室網(wǎng)絡(luò)提供的分析結(jié)果；輻射防護；質(zhì)量管理；培訓(xùn)和其他技術(shù)支持。

信息和通信系統(tǒng)辦公室

在保障司內(nèi)，信息和通信系統(tǒng)辦公室是為支持保障司規(guī)范、開發(fā)和維護信息和通信技術(shù)系統(tǒng)以及管理所有信息和通信技術(shù)基礎(chǔ)設(shè)施和服務(wù)的能力中心。