Секция общих правовых вопросов предоставляет Секретариату юридические консультации и поддержку по всем аспектам его деятельности в целях обеспечения соответствия деятельности МАГАТЭ — в особенности основной и административной — действующим соглашениям, нормам, руководящим принципам и соответствующей практике.
Секция общих правовых вопросов консультирует Агентство по вопросам его финансовых операций, надлежащего применения Финансовых положений и Финансовых правил и принятия Агентством добровольных взносов в натуральной и денежной форме. В ее функции также входит проверка соглашений о взносах и консультирование по вопросам мобилизации ресурсов и налаживания партнерских связей. Кроме того, Секция предоставляет юридические консультации и поддержку по вопросам аудита, защиты данных и разработки административных постановлений.
Секция консультирует Агентство по вопросам закупок товаров и услуг. Секция выступает представителем Бюро по правовым вопросам и выполняет функции наблюдателя в Комитете по рассмотрению закупок — междепартаментском комитете, осуществляющем надзор за заключением договоров по результатам тендера. Она также следит за тем, чтобы все соглашения и договоры, в которых участвует Агентство, были составлены в надлежащей юридической форме. Тем самым Секция играет важную роль в обсуждении, составлении и утверждении договоров и иных международных частноправовых документов.
Секция общих правовых вопросов консультирует по вопросам толкования и исполнения Соглашения о привилегиях и иммунитетах Агентства, Соглашения с Австрийской Республикой о Центральных учреждениях и соглашений с принимающими государствами в других местах нахождения, где Агентство ведет свою деятельность. Тем самым Секция обеспечивает соблюдение правового статуса, привилегий и иммунитетов Агентства и его должностных лиц. Секция также оказывает поддержку при обсуждении и заключении других международных соглашений, в том числе соглашений с правительствами принимающих стран для проведения Агентством совещаний и мероприятий в других странах. Кроме того, Секция консультирует по вопросам заключения и исполнения соглашений о сотрудничестве и взаимоотношениях между Агентством и правительствами, ООН и ее специализированными учреждениями и другими межправительственными организациями.
В сфере людских ресурсов Секция консультирует по широкому кругу административных вопросов, связанных с персоналом, в том числе по толкованию и применению Положений и правил о персонале и выработке кадровой политики. Она оказывает консультативную помощь в ходе дисциплинарных разбирательств, а также на всех стадиях обжалования административных решений, в том числе занимается подготовкой документов Агентства, подаваемых при рассмотрении апелляций в Административном трибунале Международной организации труда в Женеве, Швейцария.