2022年初，突尼斯的一家病毒學(xué)實驗室收到了獸醫(yī)懷疑感染口蹄疫的奶牛的口腔樣本?？谔阋呤且环N影響牛、豬和山羊等偶蹄動物的高度傳染性疾病，可導(dǎo)致動物和動物產(chǎn)品的地區(qū)和國際貿(mào)易中斷。該病的特征是發(fā)燒和蹄間、口腔、舌頭和嘴唇上出現(xiàn)水皰樣瘡。

突尼斯獸醫(yī)研究所病毒學(xué)實驗室的病毒學(xué)家Soufien Sghaier在將樣本提交給基因測序服務(wù)機構(gòu)的幾天內(nèi)，收到了有助于確認口蹄疫毒株正在傳播的結(jié)果。Sghaier得以通知獸醫(yī)當(dāng)局實施控制措施，以防止疾病蔓延。對毒株的及時確認，由原子能機構(gòu)與聯(lián)合國糧食及農(nóng)業(yè)組織（糧農(nóng)組織）合作完成。糧農(nóng)組織為測序服務(wù)提供便利，并提供處理結(jié)果所需的培訓(xùn)。

“我們很快收到了一例口蹄疫疑似病例的測序結(jié)果。樣本于周五被送往柏林的一家實驗室，我們于周一下午收到了測序結(jié)果。”Sghaier解釋說，“這使我們能夠在創(chuàng)紀(jì)錄的時間內(nèi)進行分析，確定口蹄疫的具體毒株。到星期二，我們已將關(guān)于口蹄疫毒株的報告發(fā)送給獸醫(yī)當(dāng)局。”為了選擇或開發(fā)有效的疫苗，需要對口蹄疫毒株進行鑒別。

基因測序?qū)τ诖_定一種流行疾病是地方性疾病還是外來輸入疾病非常重要。糧農(nóng)組織/原子能機構(gòu)糧農(nóng)核技術(shù)聯(lián)合中心動物衛(wèi)生官員Ivancho Naletoski說：“基因測序可幫助我們了解病原體（引起疾病的生物體）屬于哪個毒株，以及哪種疫苗對病原體有效?！备鶕?jù)基因測序，可以創(chuàng)建繪制物種譜系的系統(tǒng)發(fā)育樹。

“我們通過系統(tǒng)發(fā)育分析，確定我們已經(jīng)有了一種可以保護我們牛群的疫苗。獸醫(yī)當(dāng)局實施了周邊疫苗接種，以減少口蹄疫傳播的風(fēng)險?！盨ghaier說。周邊疫苗接種，或緩沖帶疫苗接種，有助于防止病毒傳播到其他地理區(qū)域。